实验室通风设计与舒适性空调系统的通风设计是有区别的。实验室通风设计有实验用的通风柜排风和室内平时排风两种，通风柜排出实验中产生的有害气体(臭气、湿气以及易燃、易爆、腐蚀性气体)。
通风柜的类别很多，包括中央实验台、边台、药品柜、器皿柜等，这些通风柜是实验室设备中最重要的设备。但它并不是室内唯一的排风装置，实验室还有平时排风口，布置在仪器室或产生危险物质的仪器上方。
设置原则：
1.分开排放
实验室通风系统的设置原则是有毒、无毒分开排放，有机物、无机物分开排放。根据各实验室的实际情况，每个实验室排风系统基本是单独设置的，少部分实验室排风系统是同层相同功能房间的多台并联系统。
2.共用系统
实验室通风柜排风与室内排风共用一套排风系统(风管及风机)。风机风速有三挡(或为变频风机)，低速时为室内平时排风，中速时为通风柜排风，高速为室内平时排风加通风柜排风。风机设置在屋面，排风管为负压，完全避免有害气体在室内泄露。
各通风系统均配有排风补风系统。低速排风时的补风由室内人员新风补充。为避免大量抽用房间内空气，造成能源的浪费
4.速度控制
对通风柜操作面的吸入风速进行控制，防止有害气体逸出。对一般无毒的污染物风速控制为0.25~0.38m/s。对一般无毒的危险的有害物风速控制为0.4~0.5 m/s，剧毒或有少量放射性物质风速控制为0.5~0.6m/s。为了确保通风顺畅，排风机应有必要的静压。另外，确定排风风速时还必须注意噪声问题，通风管道内流速以5~8m/s为限。
5.排风变频
一些有特殊排风要求的实验室(例如有药品柜、安全柜的实验室)，其排风机配置变频器，实现24小时不间断排放。而一般实验室房间排风均为负压，压差约5Pa。
6.防腐功能
有的通风柜内需要安置电炉，有的实验产生的大量酸碱有害有毒气体具有极强的腐蚀性，通风柜的台面、衬板、侧板都应具有防腐功能。使用硫酸、硝酸、氢氟酸等强酸的场合，还要求通风柜的整体材料必须防酸碱，须采用不锈钢或玻璃钢材料制造。风柜内衬板材质采用环氧树脂板。
7.噪声限值
实验室的A声级噪声限制值为50dB，增加管道截面尺寸可以降低噪声，考虑到管道的经费和施工问题，大部分风量为1600m3/h的通风柜与实验室房间的管道、有平时排风要求的竖井的截面尺寸多数为350×400mm。
8.净化处理
实验室通风柜排出的有毒和酸碱腐蚀性极强的气体会对环境造成污染，在排入大气前根据气体的成分采取吸取、过滤等措施对其进行净化处理，使排出气体有害成分低于国家环保卫生要求。
9.燃气报警
对需要氢气、乙炔和燃气的实验室，要作好房间内的通风。当实验房间没有可开启外窗时还要设置燃气泄漏报警装置(防爆型)和事故排风(换气次数为12 h-)，控制开关设在实验室便于操作的地点。
10.能耗
整个实验室虽然设置通风柜可能多达550台以上。但资料和经验表明100台通风柜中99%的时间只有18个或更少的在使用，尤其是当实验室不同时使用或放假期间，使用数量会更少，所以，不用担心通风柜带来巨大的能耗。
11.温度
对竖向设置的发热量较大的网络机房设竖向集中排风，可有效控制服务器机房的温度。
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